Tetsuo Katsuragi (桂樹 哲雄)

• 名前 桂樹 哲雄 （かつらぎ てつお）
• 学位 博士（工学）（奈良先端科学技術大学院大学 2014年9月）
• 所属 豊橋技術科学大学　情報・知能工学系
• 職位 助教
• 出身 大阪
• 言語 Python, R, Java, Visual C++, VBA, Perl, C++, Fortran
• 趣味 Heavy metal, Drums
• 連絡先 katsuragiのあとに、cs.tut.ac.jpをつけてください

学歴

• 1998年4月～2002年3月 大阪府立大学工学部海洋システム工学科

• 2003年4月～2005年3月 大阪府立大学大学院工学研究科機械系専攻 海洋システム工学分野 博士前期課程　修士（工学）取得

• 2005年4月～2011年3月 大阪府立大学大学院工学研究科航空宇宙海洋系専攻 海洋システム工学分野 博士後期課程（単位取得退学）

• 2011年10月～2014年9月 奈良先端科学技術大学院大学情報科学研究科情報科学専攻 博士後期課程　博士（工学）取得

職歴

• 2014年4月～2014年9月 日本学術振興会特別研究員（DC2）

• 2014年10月～2015年3月 日本学術振興会特別研究員（PD）

• 2015年4月～現在 豊橋技術科学大学情報・知能工学系助教

受賞

• 2015年2月 Molecular Informatics誌 Best Paper Award 2014 受賞（共著）

• 2014年11月 第37回情報化学討論会　ポスター賞受賞（共著）

• 2014年6月 第10回国際メタボローム学会 The Best Plant Metabolomics Poster Awards 受賞（主著）

• 2003年11月 2003年度造船三学会連合大会ポスターセッション優秀賞受賞（共著）

論文

学術論文（査読付き）

1. 天然有機化合物にもとづくNTG‐活性辞書システムの開発.

   • 桂樹哲雄，金谷重彦，高橋由雅
   • Journal of Chemistry，Japan，論文ID 2017-0049，(2018)，DOI:10.2477/jccj.2017-0049 ([早期公開] 公開日 2018/07/20)

2. Development and mining of a volatile organic compound database. （揮発性有機物質データベースの開発とマイニング）

   • Abdullah AA, Altaf-Ul-Amin M, Ono N, Sato T, Sugiura T, Morita AH, Katsuragi T, Muto A, Nishioka T, Kanaya S.
   • Biomed Res Int. 2015:139254. doi: 10.1155/2015/139254. (2015)

3. A Glimpse to Background and Characteristics of Major Molecular Biological Networks.（主要な分子生物ネットワークの背景及び特徴）

   • Altaf-Ul-Amin M, Katsuragi T, Sato T, Kanaya S.
   • Biomed Res Int. 2015:540297. doi: 10.1155/2015/540297. (2015)

4. Clustering of 3D-Structure Similarity Based Network of Secondary Metabolites Reveals Their Relationships with Biological Activities.（二次代謝物の3次元構造類似性の分類によって生物活性との関係を明らかにする）

   • Yuki Ohtana, Yukiko Nakamura, Azian Abdullah, Md. Altaf-Ul-Amin, Ming Huang, NaoakiOno, Tetsuo Sato, Tadao Sugiura, Hisayuki Horai, Aki Morita, Nelson Kibinge, Klaus Lange, Tetsuo Katsuragi, Tsuyoshi Shirai, Shigehiko Kanaya
   • Molecular Informatics, Vol. 33, pp. 790-801 (2014)

5. An Unsupervised Approach to Predict Functional Relations between Genes Based on Expression Data（教師なしアプローチによる遺伝子発現データにもとづく機能関連予測）

   • Md. Altaf-Ul-Amin, Tetsuo Katsuragi, Tetsuo Sato, Naoaki Ono, Shigehiko Kanaya
   • BioMed Research International, 2014, 154594.1-8 (2014)

6. SS-mPMG and SS-GA: Tools for Finding Pathways and Dynamic Simulation of Metabolic Networks（SS-mPMGとSS-GA: 代謝ネットワークにおけるパス探索と動的シミュレーションのためのツール群）

   • Tetsuo Katsuragi*, Naoaki Ono*, Keiichi Yasumoto, Md. Altaf-Ul-Amin, Masami Y. Hirai, Kansuporn Sriyudthsak, Yuji Sawada, Yui Yamashita, Yukako Chiba, Hitoshi Onouchi, Toru Fujiwara, Satoshi Naito, Fumihide Shiraishi, Shigehiko Kanaya.*Equally contributed authors
   • Plant Cell Physiol., 54, 728-739 (2013)

7. 料理のオミックス－食材からみえてくる雑煮とレトルト・カレーの構築原理

   • 桂樹哲雄, 小野直亮, 森田(平井)晶, 中村由紀子, Altaf‐Ul‐Amin Md., 金谷重彦
   • Foods & food ingredients journal of Japan, 218(1), 43—60 (2013)

8. オミックス・プラットフォーム：バイオ・ビッグ・データに挑む

   • 池田俊, 桂樹哲雄, 小野直亮, 中谷淳至, 中村由紀子, 森田晶, 金谷重彦
   • 生物工学会誌, 90, 777-781 (2012)

9. Systems Biology Approaches and Metabolomics for Understanding Japanese Traditional Kampo Medicine（システムズバイオロジーとメタボロミクスに基づいた日本の漢方薬の理解）

   • Tetsuo Katsuragi*, Farit Mochamad Afendi*, Akira Kato, Noritaka Nishihara, Kensuke Nakamura, Yukiko Nakamura, Ken Tanaka, Aki Hirai-Morita, Md. Altaf-Ul-Amin, Hiroki Takahashi, Shigehiko Kanaya. *Equally contributed authors
   • Current Pharmacogenomics and Personalized Medicine, 10, 111-124 (2012)

10. 重力流の先端部の構造(続報)

    • 馬場信弘, 桂樹哲雄, 菅貞博, 北浦堅一
    • 日本造船学会論文集(194) pp.23～29 (2003)

11. 振動流中の砂輸送に関する画像解析

    • 菅貞博, 桂樹哲雄, 馬場信弘
    • 可視化情報学会誌(23), pp. 115-118 (2003)

国際会議（査読あり）

1. NTG-Activity map of natural organic compounds based on self-organizing map (自己組織化マップに基づいた天然有機化合物のNTG - 活性地図)
   • Tetsuo Katsuragi, Yoshimasa Takahashi
   • 22nd EuroQSAR, PP132, Thessaloniki, Greece, Sep. 16-20, 2018
2. Enhancement of structure similarity search feature for an NTG – activity dictionary（NTG - 活性辞書ツールの類似性検索機能の強化）
   • Tetsuo Katsuragi and Yoshimasa Takahashi
   • 21st EuroQSAR, P124, Verona, Italy, Sep. 5, 2016
3. Making an NTG-activity dictionary of bioactive natural organic compounds（生理活性天然有機化合物のNTG - 活性辞書ツールの構築）
   • Tetsuo Katsuragi, Kazusa Noto, Shigehiko Kanaya, Yoshimasa Takahashi
   • The 10th Japan-China Joint Symposium on Drug Discovery and Development, KOE09, Niigata, Japan, Sep. 28, 2015
4. Herbal Medicine Systems: A mobile application for cross-search of various herbal medicines（Herbal Medicine Systems: 多様な薬用植物の横断検索のためのモバイルアプリケーション）
   • Sony Hartono Wijaya, Shigehiko Kanaya, Aki Hirai Morita, Shinya Muraoka, Lidwina Ayu Andarini, Yoshimasa Takahashi, Farit Mochamad Afendi, Irmanida Batubara, Latifah K Darusman, Tetsuo Katsuragi
   • The third international symposium on temulawak and potential plants for JAMU, Bogor, Indonesia, OP032, Sep. 3, 2015
5. Comparison between genetic algorithm and distributed genetic algorithm in the context of parameter estimation for dynamic simulation of metabolic networks（代謝の動的シミュレーションのためのパラメタ決定における遺伝的アルゴリズムと分散遺伝的アルゴリズムの比較）
   • Tetsuo Katsuragi, Naoaki Ono, Tetsuo Sato , Md. Altaf-Ul-Amin, Shigehiko Kanaya
   • GIW 2014, Tokyo, Japan, Dec, 15, 2014
6. Dynamic simulation of metabolic network in Arabidopsis thaliana using parameters estimated by a distributed genetic algorithm（分散遺伝アルゴリズムによって推定されたパラメータを使用したシロイヌナズナの代謝ネットワーク動的シミュレーション）
   • Tetsuo Katsuragi, Naoaki Ono, Tetsuo Sato and Shigehiko Kanaya
   • The 10th International conference of the Metabolomics Society, P311, Tsuruoka, Japan, June 25
7. Stochastic simulation of metabolic network of Arabidopsis thaliana using experimental data(実験値を用いたシロイヌナズナの確率的代謝ネットワークシミュレーション)
   • Tetsuo Katsuragi, Shun Ikeda, Md. Altaf-Ul-Amin, Aki Hirai-Morita, Kansuporn Sriyudthsak, Yuji Sawada, Yui Yamashita, Yukako Chiba, Hitoshi Onouchi, Toru Fujiwara, Satoshi Naito, Fumihide Shiraishi and Shigehiko Kanaya
   • XV International Congress on Molecular Plant-Microbe Interactions, PS15-582, Kyoto, Japan, July 31, 2012.
8. KNApSAcK Family Databases connect biological activities of metabolites and plants with microorganisms（KNApSAcK Family データベースが代謝物と植物の生物活性と微生物とをつなぐ）
   • Yukiko Nakamura, Farit Mochamad Afendi, Tetsuo Katsuragi, Shun Ikeda, Ken Tanaka, Aki Hirai-Morita, Md. Altaf-Ul-Amin and Shigehiko Kanaya
   • XV International Congress on Molecular Plant-Microbe Interactions, PS15-579, Kyoto, Japan 30, July, 2012.
9. A Study of Two Dimensional Gravity Currents Supplied with Constant Volume Fluxes（一定流量の流入により発生する2次元重力流に関する研究）
   • Tetsuo Katsuragi and Nobuhiro Baba
   • The Proceedings of the Twenty-first (2011) International Offshore and Polar Engineering Conference 2011-TPC-1145, Hawaii, USA, June, 2011
10. A study on estimation of seaweed bed restoration using deep ocean water discharge with an enclosed structure（閉鎖性水域における深層水放流による藻場の再生に関する推定）
    • Atsushi Matsui, Naoki Nakatani, Koji Otsuka and Tetsuo Katsuragi
    • The Proceedings of the Twenty-first (2011) International Offshore and Polar Engineering Conference, 2011-TPC-542, Hawaii, USA, June, 2011
11. Experiment on the turbidity currents driven by sand particles in water（水中の砂粒子によって駆動する乱泥流の実験）
    • R. Tsurumi, T. Katsuragi and N. Baba
    • Proceedings of International Conference on Experimental Fluid Mechanics, Vol. 2, Nov, 2010, 732-754, Liberec, Czech Republic
12. Experiment on the turbidity currents using a small inclined tank （斜面水槽を用いた乱泥流の実験）
    • R. Tsurumi, T. Katsuragi and N. Baba
    • Proceedings of the 5th Asia-Pacific Workshop on Marine Hydrodynamics, APHydro, Jul., 2010, 313-316.
13. Structure of the head of gravity currents in a long channel (長水路を拡がる重力流の先端部の構造)
    • Jin-ichi Koue, Takuya Katayama, Tetsuo Katsuragi, Nobuhiro Baba, and Ken-ichi Kitaura
    • The Proceedings of the Nineteenth (2009) International Offshore and Polar Engineering Conference, 2009-TPC-361, Osaka, Japan
14. Formation and development of gravity current advancing in a long channel（長水路内を拡がる重力流の形成と発達）
    • Tetsuo Katsuragi, Nobuhiro Baba, and Ken-ichi Kitaura
    • The Proceedings of the 15th (2005) International Offshore and Polar Engineering Conference, 2005-JSC-292, Seoul, Korea
15. Formation and development of spreading gravity currents（拡がる重力流の形成と発達）
    • Tetsuo Katsuragi, Nobuhiro Baba, Sadahiro Kan, and Ken-ichi Kitaura
    • The Proceedings of the 14th (2004) International Offshore and Polar Engineering Conference, 2004-YI-01, Toulon, France

国内会議（査読なし、2015年度以降のみ抜粋）

1. 活性‐活性相関を用いた一般化学物質のヒメダカに対する短期毒性（96h-LC50）の推算

   • 石川　翼，桂樹哲雄，高橋由雅
   • 第27回環境化学討論会要旨集，529-530(2018)

2. 分子行列の固有値と化合物の沸点に関する研究

   • 山下希流，桂樹哲雄，高橋由雅
   • 2018年度人工知能学会全国大会論文集，1P3-04(2018)

3. 汎用生態リスク評価管理ツールMeRAMのための化学構造辞書の構築

   • 泉原拓，桂樹哲雄，林彬勒，高橋由雅
   • 第26回環境化学討論会要旨集，483-484(2017)

4. 活性‐活性相関による魚毒性試験欠損データの補完に関する研究

   • 石川翼，桂樹哲雄，林彬勒，高橋由雅
   • 第26回環境化学討論会要旨集，485-486(2017)

5. 原子団寄与法を用いた化学物質の水溶性パラメータlogSの推算

   • 佐藤充，古川　大，桂樹哲雄，高橋由雅
   • 第26回環境化学討論会要旨集，487-488(2017)

6. アクティブQSARモデリングを用いたTFS-PLS法による魚毒性予測

   • 泉原拓，石井秀昇，桂樹哲雄，高橋由雅
   • 第45回構造活性相関シンポジウム講演要旨集，86-87(2017)

7. 原子フラグメント法による水溶解度（logS）の推算

   • 佐藤充，古川大，桂樹哲雄，高橋由雅
   • 第45回構造活性相関シンポジウム講演要旨集，114-115(2017)

8. NoSQLを用いたタンパク質ー遺伝子モチーフ辞書システムの開発とモチーフネットワーク解析への応用

   • 大友将宏，加藤博明，桂樹哲雄，高橋由雅
   • 第45回構造活性相関シンポジウム講演要旨集，112-113(2017)

9. 系列二分決定グラフによるアミノ酸配列モチーフ群表現と相動性検索システムの開発

   • 大和康平，加藤博明，桂樹哲雄，高橋由雅
   • 第45回構造活性相関シンポジウム講演要旨集，110-111(2017)

10. Structure similarity search using the hierarchy of its NTGs（NTGの階層構造を用いた類似性構造検索）

    • Tetsuo Katsuragi and Yoshimasa Takahashi
    • 第44回構造活性相関シンポジウム, 29-30, Kyoto, Japan, Nov. 17, 2016

11. Eigenvector of molecular matrix and atomic environment of molecule（分子行列の固有ベクトルと分子内環境）

    • Kouhei Murakami, Tetsuo Katsuragi, Yoshimasa Takahashi
    • 第44回構造活性相関シンポジウム, 93-94, Japan, Nov. 16, 2016

12. Fish toxicity prediction of chemicals using atomic fragment method: refinement of the fragments and improvement of the prediction model（原子団寄与法を用いた化学物質の魚毒性評価 -フラグメント定義の刷新とモデル精度の向上-）

    • Dai Furukawa, Tetsuo Katsuragi, Yoshimasa Takahashi
    • 第44回構造活性相関シンポジウム, 83-84, Kyoto, Japan, Nov. 16, 2016

13. Fish toxicity prediction of chemicals using TFS - PLS method in conjunction with Active QSAR modeling（TFS-PLS法を用いたActive QSARモデリングによる化学物質の魚毒性予測）

    • Ryota Kikuchi, Tetsuo Katsuragi, Yoshimasa Takahashi
    • 第44回構造活性相関シンポジウム, 85-86, Kyoto, Japan, Nov. 16, 2016

14. 原子フラグメント法を用いた化学物質の魚毒性予測

    • 古川大, 池上裕二, 桂樹哲雄, 高橋由雅
    • 第30回人工知能学会全国大会, 4J4-5, 北九州市, 2016年6月9日.

15. 天然有機化合物のNTG ～活性辞書ツールの開発-構造類似性検索の機能強化～

    • 桂樹哲雄, 高橋由雅

16. 偏最小二乗法を用いた化学物質の藻類に対する短期毒性予測

    • 菊地亮太, 桂樹哲雄, 高橋由雅
    • 第30回人工知能学会全国大会, 3E3-2, 北九州市, 2016年6月8日.

外部資金

1. 一般財団法人東海産業技術振興財団 第30回研究助成金 研究育成型 (1)グリーンイノベーション
   • 2018年4月～2019年3月
   • 「化学構造の多様性の可視化に関する研究」
   • 70万円
2. 科学技術振興機構バイオサイエンスデータベースセンター 平成27年度JST-NBDC統合データ解析トライアル
   • 2015年5月～2016年3月
   • 「混合生薬の横断検索のためのソフトウエアツールの開発」
   • 100万円
3. 日本学術振興会, 科学研究費補助金（特別研究員奨励費）
   • 2014年3月～2014年9月(DC2)
   • 2014年10月～2015年3月(DC2)
   • 「大規模代謝シミュレーションシステムの開発」
   • 100万円

教育関連歴

教育歴

• 2018年度 豊橋技術科学大学　B3情報・知能工学実験（組込みシステム）
• 2018年度 豊橋技術科学大学　B2情報・知能工学基礎実験（PCの分解と組み立て）
• 2018年度 豊橋技術科学大学　B1 Programming practice I (English version)
• 2017年度 豊橋技術科学大学　B3情報・知能工学実験（組込みシステム）
• 2017年度 豊橋技術科学大学　B1プログラミング演習1
• 2016年度 豊橋技術科学大学　B3情報・知能工学実験（組込みシステム・マイクロプロセッサ）
• 2015年度 豊橋技術科学大学　B3情報・知能工学実験（組込みシステム・マイクロプロセッサ）

ティーチングアシスタント

• 2013年度 長浜バイオ大学　B3生命情報化学応用実習I
• 2012年度 長浜バイオ大学　B3生命情報化学応用実習I, II
• 2010年度 大阪府立大学　B3海洋専門演習III
• 2009年度 大阪府立大学　B3海洋専門演習III
• 2008年度 大阪府立大学　B3海洋専門演習III
• 2008年度 大阪府立大学　B1海洋専門演習I
• 2008年度 大阪府立大学　B3海洋システム工学演習II
• 2007年度 大阪府立大学　B3海洋専門演習III
• 2007年度 大阪府立大学　B1海洋専門演習I
• 2006年度 大阪府立大学　B3海洋専門演習III
• 2006年度 大阪府立大学　B1海洋専門演習I